Önceki çalışmalar büyük PNH klonu ile artmış tromboz riski açısından bir ilişki olduğunu söylemesine rağmen son çalışmalarda trombotik olayların özellikle granülosit klon büyüklüğünden bağımsız olduğu ortaya konmuştur. Klon büyüklüğü %50 olan hastalarda trombotik olay gelişim sıklığı %20 iken klon büyüklüğü %20 olan hastalarda trombotik olay sıklığının hala yüksek olduğu (%16) ortaya konmuştur.